|
Indikasjon |
Mistanke om viral infeksjon i øvre eller nedre luftveier, atypisk pneumoni eller kikhoste. Ved mistenkt kikhoste anbefales nasopharynxprøve. Ved kliniske opplysninger om mistenkt kikhoste vil laboratorier vurdere tilleggsanalyser, se Kommentar. Ved mistanke om legionellose eller pneumocystose, se Legionella PCR og Pneumocystis jirovecii PCR |
|
Prøvemateriale |
Nasopharynxsekret/-aspirat Halssekret - Ved klinisk mistanke om kikhoste anbefales prøve fra nasopharynx til undersøkelse av Bordetella pertussis (pga høyere sensitivitet) Bronkoalveolær lavage (BAL), trachealsekret, ekspektorat |
|
Transportmedium/prøvebeholder |
Virustransportmedium til nasopharynxsekret og halsprøve Steril universalkonteiner til BAL, trachealsekret og ekspektorat |
|
Analysevolum |
Prøvemateriale i steril universalskonteiner: - Minimum 350 µL, tilstrekkelig prøvemateriale uavhengig av metode - Minimum 250 µL (in-house PCR) |
|
Prøvetaking |
Nasopharynxprøve: Bøyelig prøvetakingspensel føres forsiktig inn langs bunnen av nesehulen til den støter mot bakre svelgvegg, hvor den roteres i ca 5 sekunder. Sett deretter penselen ned i virustransportmediet og brekk av før korken skrus på.
Halsprøve: Bruk spatel for å holde tunga nede. Stiv prøvetakingspensel strykes over tonsiller og bakre svelgvegg i ca 5 sekunder. Sett deretter penselen ned i virustransportmediet og brekk av før korken skrus på. |
|
Prøvebehandling |
Prøven sendes snarest til laboratoriet. Oppbevares i kjøleskap før forsendelse |
|
Holdbarhet |
Prøvemateriale i steril universalskonteiner: 7 dager i kjøleskap Virustransportmedium: 7 dager i kjøleskap eller romtemperatur |
|
Merking av prøve |
Prøveglasset merkes med etikett fra etikettskriver (elektronisk rekvirering). Evt. fullt navn og fødselsnummer |
|
Metode |
PCR (polymerasekjedereaksjon)
Luftveispakken utføres rutinemessig som in-house PCR. For utvalgte inneliggende pasienter ved Stavanger Universitetssjukehus kan FilmArray PCR utføres som et alternativ, se Kommentar. |
|
Utføres |
Mandag til lørdag |
|
Svartid |
Prøver som ankommer laboratoriet før kl. 8 mandag-lørdag vil som hovedregel bli besvart samme dag. I perioder med stort prøvevolum kan svartiden bli noe lengre for polikliniske prøver. |
|
Svar/svarvurdering |
Påvist/ikke påvist/inkonklusiv |
|
Kommentar |
Analysene utføres som en analysepakke av praktiske, kliniske og epidemiologiske årsaker og følgende agens inngår: - Mycoplasma pneumoniae - Chlamydia pneumoniae - Bordetella pertussis - Influensa A og B - SARS-CoV-2 - RS-virus (respiratorisk syncytialt virus) - Humant metapneumovirus - Rhinovirus - Parainfluensavirus 1, 2, 3 - Enterovirus Adenovirus Adenovirus PCR inngår ikke rutinemessig som en del av luftveispakken, men kan bestilles som en separat analyse på klinisk indikasjon. Generelt bør luftveisprøver til PCR-undersøkelse tas så tidlig som mulig i sykdomsforløpet. Ved atypisk pneumoni med M. pneumoniae, C. pneumoniae og B. pertussis, vil PCR ofte være positiv inntil 3-4 uker etter symptomdebut. Ved lengre sykdomsforløp vil behandlingsmessige konsekvenser som regel være liten. Kikhoste: Ved oppgitte kliniske opplysninger om kikhoste vil laboratoriet etterrekvirere Bordetella parapertussis som en tilleggsanalyse. Dersom kikhoste/B. pertussis påvises, utføres B. holmesii som en tilleggsanalyse. Ved påvisning av B. holmesii svares resultatet ut med en kommentar.
Fugleinfluensa: Ved mistanke om fugleinfluensa er det avgjørende at dette oppgis under kliniske opplysninger. Ved påvist influensa A og kliniske opplysninger om mistenkt fugleinfluensa, vil laboratoriet gjøre supplerende analyser og evt videresende prøven til Folkehelseinstituttet for avklaring.
FilmArray PCR: FilmArray PCR (hurtigdiagnostikk) kan benyttes som en alternativ metode til in-house PCR hos inneliggende pasienter ved Stavanger Universitetssjukehus: · For prøver som mottas ved Avd. for medisinsk mikrobiologi fra 3E/4D, 2M, 3D, 1K/2K, utføres FilmArray når det er bestilt hurtigtest og luftveispakke (PCR). Dette gjelder ikke prøver hvor det allerede er utført hurtigtest i MOBA, disse vil bli analysert med in-house luftveispakke. · For barn < 18 år innlagt ved 2M utføres FilmArray når det er bestilt luftveispakke (PCR) dersom prøven mottas etter dagens in-house oppsett eller på dager hvor det ikke utføres in-house PCR. · For alvorlig syke, inneliggende pasienter ved 3E/4D, 2M, 3D, 1K/2K kan laboratoriet kontaktes dersom det er behov for rask avklaring (ring seksjon for molekylærdiagnostikk) Analysen utføres innenfor tidspunkt som andre hurtigtester (mandag – fredag: kl 8.00-19, lørdag – søndag: kl 8.00-13.30).
FilmArray inneholder alle agens som inngår i luftveispakken, samt; adenovirus, parainfluensavirus 4 og humane coronavirus (coronavirus 229, HKU1, NL63 og OC43). FilmArray har lavere sensitivitet for B. pertussis enn in-house PCR, og ved klinisk mistanke om kikhoste anbefales in-house PCR. Det legges også på en kommentar på svarbrevet om dette. MERS-CoV inngår også i FilmArray, men denne analysen svares ikke ut rutinemessig (analysen er ikke verifisert ved laboratoriet). Dersom MERS-CoV påvises vil rekvirent bli informert per telefon umiddelbart, og resultatet vil svares ut med en kommentar om at prøven videresendes til referanselaboratorium for bekreftelse av funnet. |
|
Avdeling |
Avdeling for medisinsk mikrobiologi Tlf: 51518800 Seksjon for molekylærdiagnostikk Tlf: 95013362 |
|
Akkrediteringsstatus |
Akkrediteringsstatus fremkommer på svarrapport og akkrediteringsomfang. Ikke akkreditert for FilmArray PCR. |
