Klinisk veileder mikrobiologiske prøver v. 2.0

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Blodbane-infeksjoner

 

 

 

 

Sepsis

Bakteriemi

Systemisk soppinfeksjon

 

Dyrkning i blodkulturflaske

Blodkultur, bakteriologisk dyrkning

Infeksjon med intravasale kateter eller

fremmedlegemer

 

Dyrkning i blodkulturflaske

Blodkultur, bakteriologisk dyrkning

 

 

Dyrkning kateterspiss/ fremmedlegeme

Intravasale fremmedlegemer, bakteriologisk dyrkning

 

Endokarditt

 

Dyrkning i blodkulturflaske

 Blodkultur, bakteriologisk dyrkning

 

 

Dyrkning av vev

Vevsprøver, bakteriologisk dyrkning

Puss og abscess, bakteriologisk dyrkning

 

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

CNS-infeksjoner

 

 

 

 

 

Bakterie/sopp CNS- infeksjoner

 

 

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Sopp dyrkning

Spinalvæske, bakteriologisk dyrkning

 

Mikroskopisk undersøkelse

Spinalvæske, mikroskopisk undersøkelse

 

 

FilmArray PCR

Spinalvæske, PCR

 

 

Virale CNS - infeksjoner

FilmArray PCR

Spinalvæske, PCR

 

In-house PCR kan benyttes som en supplerende analyse i spesielle tilfeller. Vurdering og eventuell etterbestilling gjøres av laboratoriet.

DokumentHerpes simplex-virus I og II, PCR (A) (Gyldig)

DokumentEnterovirus PCR (A) (Gyldig)

DokumentVaricella zoster virus PCR (A) (Gyldig)

 

 

Nevrosyfilis

Utføres kun dersom syfilis antistoff påvist i serum

Nevrosyfilis. TPHA antistoffbestemmelse

 

 

Nevroborreliose

IgG, IgM påvisning

Borrelia burgdorferi antistoff i spinalvæske. Nevroborreliose.

 

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Øvre Luftveis-infeksjoner

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Sinusitt, akutt ukomplisert

 

Dyrkning anbefales ikke

 

Sinusitt komplisert eller kronisk (>12 uker)

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Soppdyrkning

Øvre luftveisprøver, bakteriologisk dyrkning

 

 

SARS-CoV-2

PCR

Luftveispakke, PCR

Antistoff

SARS-CoV-2 IgG-antistoff

 

 

Otitis media

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning ved tympanocentese

Øreprøver, bakteriologisk dyrkning

 

 

Otitis externa

Aerob dyrkning

Soppdyrkning

Øreprøver, bakteriologisk dyrkning

 

 

Malign ekstern otitt/mastoiditt

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Soppdyrkning

Øreprøver, bakteriologisk dyrkning

 

 

Tonsillitt, pharyngitt akutt, ukomplisert

Aerob dyrkning

Øvre luftveisprøver, bakteriologisk dyrkning

 

 

Tonsillitt, pharyngitt komplisert, terapisvikt, residiverende/kronisk infeksjon

Aerob dyrkning

Øvre luftveisprøver, bakteriologisk dyrkning

 

 

Peritonsillær abscess

 

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Puss og abscess, bakteriologisk dyrkning

 

 

Konjunktivitt, keratitt

Aerob dyrkning

Keratitt: Anaerob dyrkning

Soppdyrkning

Øyeprøver, bakteriologisk dyrkning

 

Neisseria gonorrhoeae

Gonokokker (Neisseria gonorrhoeae), bakteriologisk dyrkning

 

Chlamydia trachomatis DNA

Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae rRNA (NAT)

 

PCR: Utføres som en analysepakke hvor følgende agens inngår:

Herpes simplex virus I og II

Herpes simplex-virus I og II, PCR

Varicella zoster virus

Varicella zoster virus PCR

Adenovirus

Adenovirus PCR

Enterovirus

DokumentEnterovirus PCR (A) (Gyldig)

 

Amøber: Avskrap fra cornea videresendes til annet laboratorium

Acanthamoeba DNA (sus.no)

 

Endoftalmitt, periorbital cellulitt

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Soppdyrkning

Mikroskopisk undersøkelse

Øyeprøver, bakteriologisk dyrkning

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Nedre Luftveis-

infeksjoner

Akutt bronkitt

Undersøkelse anbefales ikke utført rutinemessig ved akutt bronkitt

 

 

Cystisk fibrose

Aerob dyrkning

Soppdyrkning

Burkholderia dyrkning

Nedre luftveisprøver, bakteriologisk dyrkning

Pneumoni, bakteriell/sopp

Aerob dyrkning

Soppdyrkning ved spesiell indikasjon

Nedre luftveisprøver, bakteriologisk dyrkning

 

 

S. pneumoniae pneumoni

Antigentest

Pneumokokk-antigen

 

 

Pneumoni, atypisk

PCR

Luftveispakke, PCR

 

Pneumoni, viral

 

PCR

Luftveispakke, PCR

 

 

SARS-CoV-2

PCR

Luftveispakke, PCR

Antistoff

SARS-CoV-2 IgG-antistoff

 

 

Kikhoste

 

PCR

Luftveispakke, PCR

Ved klinisk mistanke om kikhoste anbefales nasopharynxsekret, ikke halssekret

 

 

Antistoff-påvisning: Bordetella pertussis toksin IgG

Bordetella pertussis IgG-antistoff

 

 

Legionella pneumoni

 

Antigentest (L. pneumophila serogr.1, 3, 4 og 6)

Legionella-antigen

 

 

PCR

Legionella PCR

 

 

Dyrkning

Legionella, bakteriologisk dyrkning

 

 

Antistoff-påvisning (Legionella pneumophila serogruppe 1-6)

Legionella antistoff

 

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Urinveis-

infeksjoner 

 

Cystitt

Pyelonefritt

Aerob dyrkning

Urin, bakteriologisk dyrkning

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Infeksjoner i mage / tarm-systemet

 

Infeksiøs gastroenteritt (bakterier, virus, cyster), inkludert EHEC/HUS

 

PCR: Feces PCR (Tarmpatogene mikrober)

Kontakt laboratoriet før prøvetakning ved klinisk mistanke om kolera (Vibrio cholera)

 

Clostridioides difficile infeksjon

Clostridioides difficile (toksinproduserende)
Clostridioides difficile (toksinproduserende)

Parasittinfeksjoner, cyster

Cyster som inngår i feces PCR: Giardia lamblia/Cryptosporidium/ Entamøba histolytica

Feces PCR (Tarmpatogene mikrober)

 

Parasittinfeksjoner, egg

Mikroskopi

Parasitter i feces, utvidet undersøkelse (egg)

Schistosoma i urin

Schistosoma i urin (Schistosoma haematobium, Schistosoma species)

 

Parasittinfeksjoner, mark

Barnemark: Tape-preparat

Parasitter i feces, utvidet undersøkelse (egg)

Makroskopisk undersøkelse av mark:

Mark tilsendt på sterilt glass tilsatt noen dråper fysiologisk saltvann

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Hud-, bløtdel- og sår-infeksjoner, abscesser etc.

 

Bakteriell infeksjon i hud og bløtvev (impetigo, follikulitt, erysipelas)

Aerob dyrkning

Hud og bløtvev, bakteriologisk dyrkning

 

 

Bakteriell infeksjon i kroniske sår (liggesår, leggsår, diabetiske sår)

Aerob dyrkning

Hud og bløtvev, bakteriologisk dyrkning

Eventuelt anaerob dyrkning etter kliniske opplysninger (nekrose/gangren)

 

 

Granulomatøs hud eller bløtdelsinfeksjon

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Soppdyrkning

Hud og bløtvev, bakteriologisk dyrkning

Mykobakteriedyrkning

Mykobakteriedyrkning, inkludert tuberkulosedyrkning

 

 

Osteomyelitt

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Proteser og andre fremmedlegemer, bakteriologisk dyrkning

 

 

Soppinfeksjon i hud, negler og hår

 

Dermatofyttdyrkning

Dermatofyttdyrkning

 

 

Soppdyrkning

Hud og bløtvev, bakteriologisk dyrkning

 

 

Sårinfeksjon etter dyrebitt

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Hud og bløtvev, bakteriologisk dyrkning

 

 

Abscesser i hud og bløtvev

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Hud og bløtvev, bakteriologisk dyrkning

Mikroskopisk undersøkelse

Mikroskopisk undersøkelse, mikrobiologiske prøver

 

 

Andre abscesser inkludert kald abscess

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Soppdyrkning

Hud og bløtvev, bakteriologisk dyrkning

Puss og abscess, bakteriologisk dyrkning

Mikroskopisk undersøkelse

Mikroskopisk undersøkelse, mikrobiologiske prøver

Mykobakteriedyrkning  

Mykobakteriedyrkning, inkludert tuberkulosedyrkning

 

 

Infeksjon i normalt sterile hulrom (artritt, bukhuleinfeksjoner, pleuritt, perikarditt, cholecystitt, cholangitt)

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Puss og abscess, bakteriologisk dyrkning

Mikroskopisk undersøkelse

Mikroskopisk undersøkelse, mikrobiologiske prøver

 

Osteosynteseinfeksjoner

Proteseinfeksjoner

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Proteser og andre fremmedlegemer, bakteriologisk dyrkning

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Genital-infeksjoner og seksuelt overførbare sykdommer

 

Seksuelt overførbare sykdommer

Bakteriologisk dyrkning:

Genitalprøve, bakteriologisk dyrkning

Genitalprøver - kvinner

Genitalprøver - menn

Gonokokk dyrkning

Gonokokker (Neisseria gonorrhoeae), bakteriologisk dyrkning

 

 

Chlamydia trachomatis DNA

Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae rRNA (NAT)

Neisseria gonorrhoeae DNA

Gonokokk (Neisseria gonorrhoeae) rRNA (NAT)

Mycoplasma genitalium DNA

Mycoplasma genitalium rRNA (NAT)

 

 

HIV antigen/antistoff-påvisning

Hiv antigen/antistoff 

Hepatitt B-virus antigen/antistoff-påvisning: Anti-HBs, HBsAg, anti-HBc Hepatitt B virus antigen/antistoff

Hepatitt C-virus antistoff-påvisning: Anti-HCV

Hepatitt C virus (HCV) antistoff (anti-HCV), Hepatitt C virus (HCV) RNA

Syfilis antistoff-påvisning

Treponema pallidum (syfilis) antistoff

 

Barn under 15 år med symptomer fra underlivet (vulvovaginitt, uretritt, fluor)

Aerob dyrkning

Soppdyrkning

Genitalprøver - kvinner

 

Truende vannavgang, PROM, infeksjonstegn under fødsel

Dyrkning på spesialmedium for GBS

Aerob dyrkning

Gruppe B streptokokk (GBS) screening

 

 

Sporadiske episoder med vulvovaginitt og cervicitt

Bakteriell vaginose

 

Vanlig bakteriologisk dyrkning av prøver tatt fra personer over 15 år er vanligvis ikke indisert

Genitalprøver - kvinner

 

Soppdyrkning

Genitalprøver - kvinner

 

Chlamydia trachomatis DNA

Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae rRNA (NAT)

Mycoplasma genitalium DNA

Mycoplasma genitalium rRNA (NAT)

Neisseria gonorrhoeae DNA

Gonokokk (Neisseria gonorrhoeae) rRNA (NAT)

 

Residiverende vulvovaginitt og cervicitt

Ytre genitalinfeksjoner postoperativt

Aerob dyrkning

Genitalprøver - kvinner

Soppdyrkning

Genitalprøver - kvinner

 

 

Bartholinitt

 

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Genitalprøver - kvinner

Gonokokk dyrkning

Gonokokker (Neisseria gonorrhoeae), bakteriologisk dyrkning

 

 

Toksisk sjokksyndrom

Aerob dyrkning

 

 

Bekkeninfeksjon/Pelvic inflammatory disease (PID)

Salpingitt

Endometritt inkludert postpartum endometritt

Infeksjon etter abort, sectio

Abscess i bekkenet

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Genitalprøver - kvinner

 

Gonokokk dyrkning ved mistanke om seksuelt overført sykdom

Gonokokker (Neisseria gonorrhoeae), bakteriologisk dyrkning

 

 

Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae og Mycoplasma genitalium DNA ved mistanke om seksuelt overførbare sykdom

Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae rRNA (NAT), Gonokokk (Neisseria gonorrhoeae) rRNA (NAT), Mycoplasma genitalium rRNA (NAT)

 

 

Uretritt

 

Aerob dyrkning

Genitalprøver - kvinner, Genitalprøver - menn

Urindyrkning

Urin, bakteriologisk dyrkning

 

 

Gonokokk dyrkning

Gonokokker (Neisseria gonorrhoeae), bakteriologisk dyrkning

 

 

Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium DNA

Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae rRNA (NAT)

Gonokokk (Neisseria gonorrhoeae) rRNA (NAT)

Mycoplasma genitalium rRNA (NAT)

 

Genitale sår

 

Aerob dyrkning

Genitalprøver - kvinner, Genitalprøver - menn

 

 

Gonokokk dyrkning

Gonokokker (Neisseria gonorrhoeae), bakteriologisk dyrkning

 

 

PCR: Utføres som en analysepakke som inkluderer

Herpes simplex-virus I/II, Varicella zoster virus og enterovirus

DokumentHud- og slimhinneinfeksjon, viral. PCR-undersøkelse (A) (Gyldig)

 

Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae DNA

Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae rRNA (NAT)

Gonokokk (Neisseria gonorrhoeae) rRNA (NAT)

 

 

Syfilis antistoff-påvisning

Treponema pallidum (syfilis) antistoff

 

 

Epididymitt

Prostatitt

Orchitt

 

Aerob dyrkning

Anaerob dyrkning

Genitalprøver - menn

 

 

Chlamydia trachomatis DNA, Neisseria gonorrhoeae DNA

Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae rRNA (NAT)

Gonokokk (Neisseria gonorrhoeae) rRNA (NAT)

 

Gonokokk dyrkning

Gonokokker (Neisseria gonorrhoeae), bakteriologisk dyrkning

 

 

Balanitt

Aerob dyrkning

Soppdyrkning

Genitalprøver - menn

 

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

 

 Hepatitt

 

 

 

 

 

Hepatitt A virus

 

Antistoff påvisning (IgM, IgG)

Hepatitt A virus (HAV) antistoff

 

 

Hepatitt B virus

 

Antistoff/antigen-påvisning: Anti-HBs, HBsAg, anti-HBc 

 Hepatitt B virus antigen/antistoff

 

 

Hepatitt B virus

 

Antistoff/antigen-påvisning: Anti-HBe, HBeAg

Hepatitt B virus antigen/antistoff

 

 

Hepatitt B PCR (kvantitativ)

Hepatitt B Virus (HBV) DNA

 

 

Hepatitt C virus

 

 

Anti-HCV

Hepatitt C virus (HCV) antistoff (anti-HCV)

 

 

Hepatitt C PCR (kvalitativ)

Hepatitt C virus (HCV) RNA

Hepatitt C PCR (kvantitativ)

Hepatitt C virus (HCV) RNA

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

 

System-infeksjoner,

artritter- reaktiv artritt

Borreliose

Antistoff-påvisning (IgG, IgM)

Borrelia burgdorferi antistoff

 

 

Cytomegalovirus, CMV

 

Antistoff-påvisning (IgM, IgG)

Cytomegalovirus (CMV) antistoff

 

 

Mononukleose, EBV

 

 

Antistoff-påvisning: VCA IgM, VCA IgG, EBNA IgG

Epstein-Barr virus (EBV) antistoff

Monospot: Heterofile antistoffer

Epstein-Barr virus (EBV) antistoff

 

 

HIV/AIDS

 

Antistoff/antigen-påvisning

Hiv antigen/antistoff

 

 

HIV PCR kvantitativ

HIV-1-RNA kvantitering

 

 

Parotittvirus

(Kusma)

Antistoff-påvisning (IgG, IgM)

Kusmavirus (parotittvirus) antistoff

 

Parvovirus B19 -infeksjon

(Erythema infectiosum / 5. barnesykdom)

Antistoff-påvisning (IgG, IgM)

Parvovirus B19 antistoff

 

 

Syfilis

(Treponema pallidum)

Antistoff-påvisning  

Treponema pallidum (syfilis) antistoff

 

 

Toxoplasmose (Toxoplasma gondii)

Antistoff-påvisning (IgG, IgM)

Toxoplasma gondii antistoff

 

 

 

PCR

Toxoplasma gondii DNA

 

 

Denguevirus-infeksjon

Antigen/antistoff-påvisning: NS-antigen, IgG, IgM

Denguevirus

Antistreptolysin O titer (AST). Reumatisk feber, akutt glomerulonefritt, erythema nodosum

 

Sendes til annet laboratorium for analyse:

Antistreptolysin O titer (AST)

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Virale hud-infeksjoner

 

Herpes simplex-virus

Antistoff-påvisning (IgG, IgM)

Herpes simplex virus (HSV) antistoff

 

 

 

PCR: Uføres som en analysepakke hvor følgende agens inngår:

Herpes simplex-virus I/II, Varicella zoster virus og enterovirus

DokumentHud- og slimhinneinfeksjon, viral. PCR-undersøkelse (A) (Gyldig)

 

 

Varicella-zoster-virus (Vannkopper/ helvetesild)

Antistoff-påvisning (IgG, IgM)

Varicella zoster virus (VZV) antistoff

 

 

 

PCR: Uføres som en analysepakke hvor følgende agens inngår:

Herpes simplex-virus I/II, Varicella zoster virus og enterovirus

DokumentHud- og slimhinneinfeksjon, viral. PCR-undersøkelse (A) (Gyldig)

 

 

Morbillivirus (Meslinger)

Antistoff-påvisning (IgG, IgM)

Meslingevirus (morbillivirus) antistoff

 

 

Rubellavirus (Røde hunder)

Antistoff-påvisning (IgG)

Rubellavirus IgG antistoff

 

 

Enterovirus

PCR: Uføres som en analysepakke hvor følgende agens inngår:

Herpes simplex-virus I/II, Varicella zoster virus og enterovirus

DokumentHud- og slimhinneinfeksjon, viral. PCR-undersøkelse (A) (Gyldig)

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

 

Myko-bakterier/ Tuberkulose

Mykobakterier

Tuberkulose

Granulomatøs betennelse

 

Dyrkning

Mykobakteriedyrkning, inkludert tuberkulosedyrkning

 

PCR direkte i prøvematerialet

Mycobakterium tuberculosis komplekset (TB) PCR

 

Direkte mikroskopi

Mykobakteriedyrkning, inkludert tuberkulosedyrkning

 

Quantiferon

Quantiferon (QFT)- TB (IGRA)

 

 

Sykdom gruppe/ lokalisasjon

Infeksjon Problemstilling

Metoder/ undersøkelser

 

Screening-

prøver

MRSA. Meticillinresistente staphylococcus aureus

Dyrkning på spesialmedium for MRSA

MRSA screening

 

 

ESBL. Extended spectrum betalactamase

 

Dyrkning på spesialmedium for ESBL

ESBL screening

 

 

VRE. Vancomycin resistent enterococcus

 

Dyrkning på spesialmedium for VRE

VRE screening

 

 

GBS: Gruppe B streptokokker. Screening av gravide fra uke 35

Dyrkning på spesialmedium for GBS

Gruppe B streptokokk (GBS) screening

Aerob dyrkning

 

 

Screening av enkelte inneliggende pasienter etter utenlandsopphold

 

Dyrkning på flere ulike spesialmedium

Multiresistente bakterier ( MRSA, ESBL, VRE med flere) - screening og tiltak hos pasienter (Ikke tilgjengelig)