16S rRNA PCR og sekvensering v. 1.0
Indikasjon

Dyrkningsnegative prøver fra antatt sterile områder hvor 

-pasienten har fått antibiotikabehandling før prøvetakning

-det mistenkes tilstedeværelse av bakterier som er vanskelig å dyrke (langsomtvoksende bakterier eller bakterier med særskilte vekstkrav)

Dyrkningspositive prøver med forventet polymikrobiell vekst hvor vanlig bakteriologisk dyrkning viser færre bakteriefunn enn forventet (hjerneabscess, nekrotiserende fasceitt) 
Prøvemateriale

Prøver fra normalt sterile områder, for eksempel vevsprøver, pleuravæsker, leddvæsker og abscesser.

Det foretrekkes at prøvene sendes til laboratoriet i steril universalkonteiner. Penselprøve på flytende Amies medium (eSwab) har noe redusert sensitivitet.

Prøve i to sterile universalkontainere (en til bakteriologisk dyrkning og en til bakteriesekvensering) er å foretrekke. 
Prøvebehandling Oppbevares i kjøleskap (4 °C)
Holdbarhet 7 dager
Bestilling av analyse Siden det samtidig alltid bør utføres vanlig bakteriologisk dyrkning, kan ikke analysen bestilles i Tjenestekatalogen. Bestill derfor vanlig bakteriologisk undersøkelse, og oppgi ønsket analyse og indikasjon i feltet for kliniske opplysninger.
Merking av prøve

Prøveglasset merkes med etikett fra etikettskriver (elektronisk rekvirering). Eventuelt fullt navn og fødselsnummer.
Metode PCR (polymerasekjedereaksjon) 
Utføres To ganger i uken
Svarvurdering

Bakterielt genmateriale påvist/ikke påvist

Ved påvist genmateriale blir bakterien identifisert til genus eller species nivå. Identifikasjonen utføres ved Haukeland Universitetssykehus og prøven videresendes dersom aktuelt.
Kommentar

Prøver som IKKE er egnet for analyse:

-Prøver fra områder med normalflora som sårsekret og luftveisprøver

-Urin 

-Ascitesvæske eller abscesser i forbindelse med tarm

Pleuravæsker sendes fortløpende til HUS for empyem-PCR som er en mer sensitiv analyse
Avdeling

Avdeling for medisinsk mikrobiologi

Tlf: 51518800

Seksjon for Forskning og utvikling

Tlf: 90591542
Akkrediteringsstatus Akkrediteringsstatus fremkommer på svarrapport og akkrediteringsomfang